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英伟达与华大基因合作 使用 CUDA 进行全基因组测序
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英伟达与华大基因合作 使用 CUDA 进行全基因组测序

2019-12-27 13:42:15 来源:雷锋网

【大比特导读】在GTC2019大会上,英伟达CEO黄仁勋带来了AI框架、开发工具、数据科学、云计算、实时渲染以及5G等等方面的新动作。而在垂直领域,黄仁勋则表示,从运输、医疗、金融到零售,各行各业都在争相利用AI的自动化能力。

在GTC2019大会上,英伟达CEO黄仁勋带来了AI框架、开发工具、数据科学、云计算、实时渲染以及5G等等方面的新动作。而在垂直领域,黄仁勋则表示,从运输、医疗、金融到零售,各行各业都在争相利用AI的自动化能力。

今年,英伟达为CUDA增加了两个新的主流应用——5GvRAN和基因组处理,基因组行业的华大基因对应用实现了支持。

现场,黄仁勋发布NVIDIAParabricks基因组分析工具包,Parabricks是一个基于CUDA加速的基因组处理工具包,可以用于发现变异,并能产生与GATK最佳实践流程一致的结果,实现30-50倍的加速。

Parabricks提供了DeepVariant工具,利用深度学习技术进行基因变异检测。现在,华大基因就采用了Parabricks。借助若干GPU服务器,华大基因可以按照测序仪生成数据的速率来处理基因组。

当然,除了发布会上推出的工具包,2018年11月,英伟达还推出了专门针对医疗影像的超算平台Clara,让开发人员通过开发各种应用程序来处理现有数据。但是,在今天的发布会上,黄仁勋并没有现场展示CLARA的相关内容。

对此,在接受采访时,黄仁勋开玩笑说,发布会只有短短的两个小时,他无法将所有的东西都展示出来。但是他特别提及了联邦学习,他表示,很多公司都希望利用这种方法去解决数据隐私问题。“事实上,上午我们展示联邦学习技术在自动驾驶上的应用,在医学影像上也是共通的。英伟达提供的DriveFederatedServerGlobalModel可以提供给每个OEM厂商使用,结合各自的数据,帮助各个厂商提升彼此的模型。”

此前,英伟达医疗副总裁KimberlyPowell曾表示,医疗领域是英伟达规模最大、也是最为成熟的一个领域。而英伟达更多的是扮演一个“赋能者”的角色,为整个AI生态系统打造了一个完善的开发工具,帮助创业公司更好地执行医疗AI的应用。

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